در پی مرگ رئیس‌جمهوری اسلامی و همراهانش در سانحه سقوط بالگرد، هیئت دولت دوشنبه ۳۱ اردیبهشت ۱۴۰۳، تشکیل جلسه فوق‌العاده داد. در این جلسه بر صندلی خالی ابراهیم رئیسی، پارچه سیاه انداختند. هیئت دولت در بیانیه‌ای در رابطه با مرگ رئیس دولت سیزدهم و ادامه این دولت نوشت: «به ملت وفادار و قدرشناس و عزیزمان اطمینان می‌دهیم مسیر پرافتخار و خدمت با تأسی به روحیه خستگی‌ناپذیر آیت‌الله رئیسی قهرمان و خادم ملت و یار وفادار رهبری ادامه خواهد داشت و با استعانت از خدای متعال و همراهی مردم بزرگوار کوچکترین خللی در مدیریت جهادی کشور ایجاد نخواهد شد.» همچنین قرار است که زمان و مکان مراسم خاکسپاری رئیسی و همراهانش اطلاع‌رسانی شود. بر اساس اصل ۱۳۱ قانون اساسی جمهوری اسلامی، در صورت مرگ رئیس‌جمهوری، معاون اول او با موافقت رهبر جمهوری اسلامی، اختیارات و مسئولیت‌های او را برعهده می‌گیرد. همچنین شورای متشکل از معاون اول، رئیس مجلس و رئیس قوه قضائیه موظف هستند شرایطی را فراهم کنند که ظرف مدت حداکثر ۵۰ روز، رئیس‌جمهوری جدید انتخاب شود. در واکنش به مرگ ابراهیم رئیسی، بورس هم تعطیل شد. رضا عیوضلو، عضو هیئت مدیره سازمان بورس و اوراق بهادار اعلام کرد که بورس تعطیل است و برای روزهای آینده اطلاع‌رسانی خواهند کرد. مجلس هم اعلام کرد که فردا (سه‌شنبه)، جلسه علنی مجلس تشکیل نمی‌شود و دو مراسم اختتامیه دوره یازدهم و افتتاحیه دوره دوازدهم به سبک و سیاق قبلی برگزار نخواهد شد و در روزهای شنبه و یکشنبه هفته آینده تشکیل می‌شود.