با گذشت نزدیک به سه ماه از اعتراضات سراسری آبان ۹۸ تاکنون هیچ مقام مسئولی در نظام جمهوری اسلامی آمار مشخصی درباره تعداد کشته، زخمی و بازداشت‌شده‌ها اعلام نکرده است. صدها تن از بازداشت‌شدگان این اعتراض‌ها در زندان فشافویه محبوس هستند.
سازمان حقوق بشر ایران ۳۰ آذر ۹۸ در گزارشی اعلام کرد حدود ۱۰ هزار نفر از معترضان در جریان اعتراضات آبان‌ماه بازداشت و یا تحت پیگرد قرار گرفته‌اند. بسیاری از این زندانیان همچنین به دلیل فشار و تهدید نهادهای امنیتی، به صورت گمنام و ناشناس باقی مانده‌اند.
یک منبع آگاه به زمانه گفته است بیش از ۴۰۰ نفر از بازداشت‌شدگان اعتراضات آبان ۹۸، عمدتا از ساکنین شهرهای شهریار، اسلامشهر، شهر قدس (قلعه حسن‌خان)، ملارد و رباط کریم، در زندان تهران بزرگ (فشافویه) نگهداری می‌شوند. به گفته این منبع بسیاری از بازداشت‌شدگان افراد ۱۸ تا ۲۵ ساله و عمدتا از قشر فرودست جامعه هستند.
این بازداشت‌شدگان به دلیل نداشتن پول تا مدت‌ها پس از بازداشت امکان تماس از زندان با خانواده‌ها‌یشان و اطلاع‌‌رسانی در مورد وضعیت‌شان را نداشته‌اند.
اطلس زندان‌های ایران ۱۳ آبان ۹۸، با اشاره به این که تعدادی از بازداشت‌شدگان اعتراضات آبان هنگام بازداشت بر اثر اصابت گلوله زخمی شده بودند، اسامی چهار معترض زخمی بازداشت‌شده در زندان تهران بزرگ (فشافویه) را منتشر کرده است.
این بازداشت‌شدگان به نام‌های جعفر رضایی، رضا الله‌یاری، سیامک پایمرد و وحید نجفی‌خوبستانی در هنگام بازداشت بر اثر اصابت گلوله زخمی شده بودند و همچنان در زندان فشافویه به سر می‌برند.
به گزارش اطلس زندان‌های ایران، این چهار زندانی در تیپ ۵ زندان تهران بزرگ (فشافویه) و در شرایط بسیار ناگواری زندانی هستند.
یک منبع آگاه در این مورد به اطلس زندان‌های ایران گفته است:
«این زندانیان بدون مراقبت‌های پزشکی لازم همچنان پر تیپ ۵ زندان تهران بزرگ نگهداری می‌شوند. در این بند فقط یک پرستار مشغول کار است و امکانات پزشکی و دارویی محدودی در اختیار دارد و شرایط این زندانیان مناسب نیست.»
بنا بر اطلاعات اطلس زندان‌های ایران، زندان فشافویه نه تنها از امکانات پزشکی مناسب برخوردار نیست، بلکه امکانات آن به طور کلی نامناسب است، به گونه‌ای که حتی زندانیان سالم نیز به دشواری در آن به سر می‌برند.
اطلس زندان‌های ایران ۱۱ بهمن ۹۸ در گزارش دیگری، اسامی ۹۷ نفر از بازداشت‌شدگان اعتراضات آبان ۹۸ را که در زندان فشافویه زندانی هستند، منتشر کرده بود.