عیسی کلانتری در واکنش به شکایت دادستان عمومی و انقلاب بندر انزلی از او به عنوان رئیس سازمان محیط زیست گفت دادستان انزلی گفته است روش عمل در تالاب انزلی علمی نیست: «ما خوشحال می‌شویم دادستان علمی بودن یا علمی نبودن این روش را بازگو کند. ما بررسی‌هایی را که از طریق دانشگاه‌های شریف، تهران و شیراز انجام شده بود به دادستان ارائه کرده‌ایم.»کلانتری همچنین گفت اگر احضار شود، حتما به دادگاه خواهم رفت. در روزهای گذشته دادستان عمومی و انقلاب بندر انزلی علیه عیسی کلانتری، رئیس سازمان حفاظت محیط‌زیست به اتهام «تخریب محیط‌زیست»، «تضییع حقوق بیت‌المال» با اجرای طرح بایوجمی در تالاب انزلی و «نشر اکاذیب» اعلام جرم کرده است. طرح بایوجمی که به صورت محصور و ایزوله و با اختصاص حدود ۴۵ میلیارد تومان از سوی سازمان حفاظت محیط زیست در تالاب انزلی در حال اجرا بود در اواخر خرداد ماه گذشته به دستور دادستان عمومی و انقلاب بندر انزلی متوقف شد. به گفته کارشناسان، به دلیل احداث ۲۰ سد بر روی رودخانه ولگا در کشور روسیه که بیش از ۷۵ درصد آب دریای خزر را تامین می‌کند و به دنبال آن، کم شدن آب دریای خزر، دبی ورود آب به تالاب انزلی نیز افت شدیدی پیدا کرده است. گفته می‌شود وزارت امور خارجه ایران تا کنون برای مذاکره به منظور باز شدن دریچه‌های سد رودخانه ولگا در کشور روسیه تلاشی نکرده است.