غضنفر فولادی، رییس کمیسیون عالی سوانح شرکت راه‌آهن سه‌شنبه ۹ مهر درباره علت وقوع حادثه خارج و واژگون شدن پنج واگن قطار زاهدان-تهران گفت: «علت سانحه را مشخص و گزارش آن را برای دولت و وزیر راه و شهرسازی نیز ارسال کردیم. بر اساس این گزارش، علت حادثه ریلی قطار زاهدان-تهران بازشدن پیچ، پابندها و فنرهای ریل توسط افراد ناشناس بوده است.» به گفته این مقام مسئول «برخی افراد ناشناس حدود ۱۷۰ تا ۱۸۰ پیچ و پابند ریل را در طول حدود ۵۰ تا ۶۰ متر باز و نقطه خطر ایجاد کردند و همین مسئله باعث خارج شدن قطار از ریل و بروز آن سانحه دردناک شده است.» بعد از ظهر چهارشنبه ۳ مهر قطار زاهدان – تهران در منطقه «شورو» زاهدان از خط خارج و یکی از واگن‌های آن واژگون شد. تعداد دقیق مجروحان اعلام نشد اما کمتر از ۶۵ نفر نبود.