وزارت علوم با صدور بخشنامه‌ای اعلام کرده بود که دارندگان سطح چهار حوزه حق ندارند از عنوان دکتری استفاده کنند. یک عضو هیأت علمی دانشگاه قم به دیوان عدالت اداری شکایت برده بود. دیوان عدالت اداری اما شامگاه چهارشنبه ۴ دی بخشنامه وزارت علوم را تأیید کرد. دیوان عدالت اداری با استناد به مصوبه شورای انقلاب فرهنگی اعلام کرد سطح چهار حوزه در سطح دکتری دانشگاهی نیست و به همبن جهت بخشنامه وزارت علوم همچنان معتبر است. علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی پیش از این با اظهار ناخشنودی از رقابتی که بین آیت‌الله‌ها حوزه‌های علمیه بر سر عنوان دکتری در گرفته بود، گفته بود: «اشتباه بزرگ این بود که آمدند این شهادت را با شهادت‌های دانشگاهی مخلوط کردند. حالا اول می‌خواستند اسمش را دکتری و مانند اینها بگذارند که غلط بود، بعد معادل دکتری گذاشتند، این هم هیچ لزومی ندارد.» بر اساس مدرک صادرشده مرکز مدیریت حوزه علمیه قم، دارندگان سطح ۴ از کلیه مزایای علمی و استخدامی فارغ‌التحصیلان دوره دکتری دانشگاه‌ها برخوردارند. دیوان عدالت اداری این مزایا را تأیید کرد.