اسماعیل خطیب، وزیر اطلاعات دولت مسعود پزشکیان روز شنبه ۳ شهریور به وبسایت جماران گفت که ترور هنیه در تهران نتیجه نقش‌آفرینی عوامل نفوذی اسرائیل در جمهوری اسلامی نبوده است. خطیب در این مصاحبه گفت که «بر اساس گزارشات و اطلاعیه‌ای که سپاه پاسداران داده، برای این موضوع نقشی دیده نشده است.» ترور اسماعیل هنیه، رهبر سیاسی حماس در ۱۰ مرداد هنوز ابهام‌های بسیاری دارد. مقام‌های جمهوری اسلامی هنوز در مورد نحوه کشته شدن هنیه گزارشی منتشر نکرده‌اند. از همان ساعات اولیه ترور موضوع نفوذ اسرائیل در لایه‌های امنیتی جمهوری اسلامی به عنوان متهم اصلی در روایت‌های رسانه‌ای جمهوری اسلامی وارد شد. روزنامه جمهوری اسلامی در شماره پنج‌شنبه ۱۱ مرداد خود «نفوذ در ارکان امنیتی جمهوری اسلامی» را دلیل این رویداد خواند و خواستار «پاکسازی ریشه‌ای در دستگاه‌های امنیتی و اطلاعاتی» در جمهوری اسلامی شد.