جند روز پس از آنکه سخنگوی پیشین و عضو حقوق‌دان شورای نگهبان در مصاحبه با وبسایت علی خامنه‌ای گفت که همه‌پرسی برای کشور مضر است و اختیارات و دستورات علی خامنه‌ای را نمی‌شود به همه‌پرسی گذاشت، سخنگوی کنونی شورای نگهبان هم گفت تنها در مورد موضوعاتی که مجلس حق قانونگذاری دارد می‌توان همه‌پرسی گذاشت و نه همه چیز. هادی طحان نظیف در نشست خبری روز شنبه‌اش گفت: «همه‌پرسی تاکنون سه بار در کشور ما انجام شده است. قانونگذاری باید از سوی نمایندگان انجام شود و راه اصلی تقنین از طریق نمایندگان مجلس است. در متن اصل ۵۹ قانون اساسی نیامده است که در همه مسائل باید همه‌پرسی کرد.» عباسعلی کدخدایی هم هفته گذشته در رپورتاژ وب‌سایت رهبر جمهوری اسلامی علیه رفراندوم گفت که «همه‌پرسی ممکن است در یک مواقعی مشکلی را حل بکند اما در بسیاری از مواقع نه‌تنها مشکلی را حل نمی‌کند بلکه مشکلاتی را ایجاد می‌کند.» کدخدایی هم در تفسیری جدید از قانون اساسی گفت که همه‌پرسی تنها محدود به موضوعاتی است که «مجلس می‌تواند در موردشان تصمیم بگیرد» و نه همه مسائل. به بیان دیگر در مورد سیاست خارجی، هسته‌ای، سیاست‌های کلی نظام و هر آن‌چیزی که خامنه‌ای تصمیم‌گیری در مورد آن را منحصر به خودش می‌داند اساسا خبری از همه‌پرسی نیست. علی خامنه‌ای روز ۲۹ فروردین در دیدار با گروهی از دانشجویان بسیجی مخالفتش را با برگزاری همه‌پرسی اعلام کرد و گفت که مردم قدرت درک موضوعات پیچیده را ندارند و با تبلیغات و هجوم رسانه‌ای رایشان تغییر می‌کند.