علیرضا اعرافی، مدیر حوزه‌های علمیه در ایران در نشستی که با جمعی از استادان و مسئولان برگزار کرد در انتقاد از ناهماهنگی‌ و اشفتگی در ساز و کار حوزه‌های علمیه گفت: «امروز بسیاری از سنگرها را از دست دادیم و در بسیاری از مسایل دچار تفرق شده‌ایم. در تبلیغ و تبیین دین، یک انسجام و راهبری واحدی وجود ندارد. بسیاری از امور تبلیغی مرتبط به سازمان‌های مختلف است و حتی بعضی وقت ها که ورود می کنیم می گویند که این امور مرتبط به جای دیگر است.» اعرافی در ادامه به بی‌اطلاعی آخوندها از مسائل روز در جهان اشاره کرد و گفت: «باید بدانیم نیازهای روز چیست. بسیاری از ما نمی دانیم که نیازهای امروز و معادلات این دنیا چیست. رهبری بیان کردند، ما افرادی را می خواهیم که معادلات روز را بشناسد.» تباهی و انحطاط روحانیت موضوع تازه‌ای نیست و هر چند گاه یک بار، به ویژه از سال ۱۴۰۰ به این سو مطرح می‌شود. در یکی از آخرین موارد آیت‌الله محقق داماد در سخنانی در دانشگاه بهشتی گفته بود یکی از مشکلات حوزه‌ها وابستگی مالی آن‌ها به دولت است. پیش از آن هم رئیس جامعه مدرسین حوزه‌های علمیه قم با اشاره به «موقوفه‌خواری» ضرورت عدم وابستگی حوزه‌ها به دولت را مطرح کرده بود.