پیش از این مقرر شده بود که به‌منظور جلوگیری از فرار مالیاتی، پزشکان از کارتخوان‌ها استفاده کنند اما به‌گزارش خبرگزاری دانشجویان ایران (ایسنا) تا پایان سال سال ۱۳۹۸، تنها ۵۰ درصد از پزشکان به این قانون تمکین کردند. با گسترش ویروس جدید کرونا و تعطیلی بسیاری از مشاغل و کسب‌وکارهای خرد این موضوع نیز معلق ماند اما امیدعلی پارسا، رئیس سازمان امور مالیاتی به ایسنا گفته است که به دلیل شیوع این ویروس، اجرای تمام تکالیف مالیاتی چند ماهی به تعویق افتاده و الزام مشاغل هم به استفاده از کارتخوان که قرار بود فروردین‌ماه سال ۱۳۹۹ عملیاتی شود، به شهریورماه سال جاری منتقل می‌شود. گفته می‌شود که فرار مالیاتی پزشکان در ایران حدود ۶۷۰۰ میلیارد تومان است. یکی دیگر از اقدامات سال جاری در این زمینه ابلاغ دستورالعمل اخذ مالیات علی‌الحساب پزشکان است که براساس آن کلیه مراکز درمانی باید معادل ۱۰ درصد از حق‌الزحمه پزشکی که به موجب دریافت وجه صورت‌ حساب‌های ارسالی به بیمه‌ها، یا به صورت نقد از بیمار پرداخت می‌شود، به‌عنوان علی‌الحساب به مالیات کسر کنند و به نام پزشک مربوطه تا پایان ماه بعد از وصول مبلغ صورت حساب، به حساب سازمان امور مالیاتی واریز کنند. پزشکان داروساز و علوم آزمایشگاهی از دستورالعمل دریافت مالیات معاف هستند.