رئیس کمیسیون آموزش و تحقیقات مجلس با اشاره به حواشی مربوط به حکم انفصال روسای دانشگاه‌ها در پرونده بورسیه‌ها گفته: «انتظار داریم وزیر علوم خیلی جدی به این پرونده ورود و مساله را در فراکسیون مطرح کند.»
محمدرضا عارف روز شنبه دوم شهریور ماه در گفت‌و‌گو با خبرگزاری دولتی کار ایران (ایلنا) بر لزوم پیگیری پرونده بورسیه‌ها از سوی وزیر علوم تاکید کرده: «انتظار جامعه دانشگاهی این است که وزیر علوم با مسأله درگیر شود و به طور جدی آن را پیگیری کند. اگر رؤسای دانشگاه‌ها وظیفه قانونی خود را انجام دهند، به این صورت نیست که توبیخ یا حکم انفصالی در کار باشد، البته اگر در این میان اشتباهی هم رخ داده، باید اصلاح شود.»
عارف در ادامه با اشاره به صلاحیت علمی بعضی افراد در دانشگاه‌ها گفته: «در حال حاضر مساله رؤسای دانشگاه این است که این افرادی که پرونده بورسیه دارند، اصلا صلاحیت علمی ندارند و شاید صلاحیت علمی آنها در چهار، پنج سال گذشته یعنی زمانی که می‌خواستند بورسیه بگیرند، تایید شده است که اکنون هم مورد تأیید نیست.»
این نماینده مجلس در ادامه با اشاره به ساز و کار جذب هیات علمی در دانشگاه‌ها گفته است: «ساز و کار جذب هیات علمی مشخص است و افراد باید حداقل‌های صلاحیت علمی را داشته باشند. این موضوع ربطی به نوع تقاضا ندارد؛ چه بورسیه باشد چه متقاضی آزاد در داخل یا خارج از کشور، باید دارای صلاحیت علمی باشد.»
محمدرضا عارف همچنین گفته: «این سیاست‌های شورای انقلاب فرهنگی و شورای جذب است که با مکانیزم‌های داخل دانشگاه، از طریق گروه، دانشکده و در نهایت شورای جذب دانشگاه، صلاحیت‌ها تایید و سپس فرد عضو هیات علمی می‌شود که بسیار شفاف و روشن است. همه افراد باید از این مسیر عضو هیات علمی شوند؛ عموما دانشگاه خارج از این مسیر کسی را نمی‌پذیرد.»
در دوره دولت یازدهم مساله دادن بورسیه‌های رانتی باعث شد تا رضا فرجی دانا، وزیر وقت علوم در دولت محمود احمدی‌نژاد از سوی نمایندگان مجلس استیضاح شود.
در ابتدای مردادماه سال جاری بنا بر اعلام خبرگزاری‌ها، روسای دانشگاه‌های کاشان و تربیت مدرس به دلیل تخلف در به کارگیری دانشجویان بورسیه با حکم دیوان عدالت اداری حکم انفصال از خدمت دریافت کرده‌اند.
به نوشته خبرگزاری دانشگاه آزاد اسلامی در دوم مرداد ماه گذشته، پرونده بورسیه‌ها بیش از پنج سال است در دیوان عدالت اداری باز است و در حال حاضر بیش از هزار و ۲۰۰ دانشجو نسبت به پذیرش بورسیه‌ها در برخی از دانشگاه‌های دولتی اعتراض کرده‌اند.