خالد شيخ محمد و چهار نفر ديگر به عنوان متهمان حملات ۱۱ سپتامبر در دادگاهی نظامی در گوانتانامو محاکمه شدند. آن‌ها اين محاکمه را “ناعادلانه” خوانده‌اند.
خالد شيخ محمد که از وی به عنوان “طراح اصلی” حملات ۱۱ سپتامبر به آمريکا نام برده می‌شود و متهمان ديگر در اولين جلسه تفهيم اتهام که ۱۷ ارديبهشت ۱۳۹۱ برگزار شد، از پاسخ دادن به پرسش‌های دادگاه خودداری کردند.
به گفته وکيل اين پنج نفر “متهمان با سکوت خود صلاحيت دادگاه نظامی را به رسميت نشناختند.”
اين افراد به “تروريسم، هواپيماربايی و قتل نزديک به سه‌هزار نفر” متهم شده‌اند که در صورت اثبات آن در دادگاه ممکن است به مجازات مرگ محکوم شوند.
به گفته وکيل متهمان حملات ۱۱ سپتامبر اين افراد با سکوت خود صلاحيت دادگاه نظامی را به رسميت نشناختند
پيش از اين باراک اوباما، رييس جمهور آمريکا، قصد داشت اين متهان را برای محاکمه به زندانی در نيويورک منتقل کند اما پس از مواجه شدن با اعتراضات جمهوری‌خواهان از اين تصميم خود عقب‌نشينی کرد.
مظنونان به تروريسم به اين دليل به زندان گوانتانامو در خاک کوبا منتقل می‌شوند که از حقوق يک زندانی در آمريکا برخوردار نباشند.
زندان گوانتامو در پايگاه نظامی آمريکا در خاک کوبا قرار دارد. نخستين گروه از زندانيان متهم به تروريسم ۱۱ ژانويه سال ۲۰۰۲ وارد اين زندان شدند. هم‌اکنون ۱۷۱ نفر در اين زندان در حبس هستند.
جورج بوش، رئيس‌جمهور پيشين آمريکا پس از رويداد ۱۱ سپتامبر ۲۰۰۱ دستور تأسيس بازداشتگاه گوانتانامو و شبکه‌ای از بازداشتگاه‌های سری را، برای حبس و بازجويی مظنونان به تروريسم صادر کرد.
عمده زندانيان کسانی هستند که توسط ارتش آمريکا در افغانستان و عراق بازداشت شده‌اند.
باراک اوباما بعد از آنکه به عنوان رئيس‌جمهور آمريکا انتخاب شد، دستور داد اين زندان تا ژانويه ۲۰۱۰ تعطيل شود اما اين تصميم وی عملی نشد.
اوباما به هنگام امضای اين دستور گفت: “ايالات متحده مجبور نيست به انتخاب دروغين ميان امنيت خود و آرمان‌های خود ادامه بدهد.”
وی گفته بود: “صدور اين دستور برای بازگشت به معيارهای روند قضايی و ارزش‌های بنيادين قانون اساسی است. ارزش‌هايی که به اين کشور، حتی در جريان جنگ و در مقابله با تروريسم، عظمت می‌بخشند.”
با اين حال با گذشت سه سال از اين دستور، اين زندان هنوز فعاليت می‌کند.
در يکی از آخرين اعتراض‌ها به اين زندان، فعالان حقوق بشر در دهمين سال آغاز به کار زندان گوانتانامو (چهارشنبه ۱۱ ژانويه ۲۰۱۲- ۲۱ دی ۱۳۹۰) در مقابل کاخ سفيد تجمع اعتراضی برپا کردند.
شرکت‌کنندگان در اين اعتراض به شکل زندانيان گوانتانامو، لباس نارنجی پوشيده و سرهای خود را پوشانده بودند. فعالان حقوق بشر ضمن اعتراض به ادامه فعاليت زندان گوانتانامو، اين زندان را يک “رسوايی” برای آمريکا توصيف کردند.