شورای عالی انقلاب فرهنگی ايران طی نامه‌ای به محمود احمدی‌نژاد، رئيس‌جمهور پيشين ايران و رئيس دانشگاه ايرانيان اعلام کرده که اين دانشگاه مجوزی برای ادامه فعاليت ندارد.
به گزارش روز شنبه ۲۲شهريور روزنامه شرق، شورای عالی انقلاب فرهنگی در تاريخ ۱۷تير ۱۳۹۳طی نامه‌ای مصوبه ۲۵تير ۱۳۹۲خود را در مورد «تأسيس دانشگاه بين‌المللی به رياست محمود احمدی‌نژاد» لغو کرده و اين نامه را به احمدی‌نژاد نيز ابلاغ کرده است.
در همين حال محمد محمديان، رئيس نهاد نمايندگی رهبر جمهوری اسلامی در دانشگاه‌ها نيز گفته است: «ما به‌عنوان نماينده ولی فقيه اظهارنظری درباره مجوز يا عدم مجوز دانشگاهی نمی‌کنيم اما مجوزهای لازم دانشگاه ايرانيان متأسفانه اخذ نشده است و در جلسه آخر شورای عالی انقلاب فرهنگی تصريح شد که مقدمات آن کاملا طی نشده است.»
در همين حال، هفته گذشته يک عضو کميسيون برنامه، بودجه و محاسبات مجلس گفت که حميد بقايی از نزديکان احمدی‌نژاد پيش از آن‌که اين دانشگاه به‌طور رسمی به ثبت برسد، ۱۶ميليارد تومان از محمود احمدی‌نژاد دريافت و به حساب دانشگاه ايرانيان واريز کرده است.
بر اساس اعلام اداره کل ثبت شرکت‌ها و مؤسسات غير تجاری، «دانشگاه جامع بين‌المللی ايرانيان» در تاريخ ۲۶مرداد سال ۱۳۹۲به ثبت رسيده است، در حالی که تمام مراحل تقاضا، موافقتنامه، حواله و واريز مبلغ ۱۶ميليارد تومان به حساب اين دانشگاه قبل از ۲۶مرداد انجام شده است.