به فاصله کوتاهی پس از انتشار خبر موافقت علی خامنه‌ای با استعفای محسن رضایی از دبیری مجمع تشخیص مصلحت، صادق آملی لاریجانی، رئیس این مجمع محمدباقر ذوالقدر از فرماندهان سابق سپاه پاسداران را جایگزین او کرد. ذوالقدر در دوره ریاست جمهوری محمود احمدی نژاد «با مجوز رهبر جمهوری اسلامی» به مقام معاون امنیتی و سیاسی وزیر کشور منصوب شد، اما پس از دو سال بنا به دلایلی که هرگز اعلام نشد، برکنار شد. دبیر جدید مجمع تشخیص مصلحت نظام که همانند محسن رضایی از سپاه پاسداران می‌آید از سال ۱۳۹۱ تا ۱۳۹۹ معاون راهبردی قوه قضاییه بود و پس از آن نیز به عنوان مشاور رئیس قوه قضاییه به کار در دستگاه قضایی ادامه داد. او در دوره ریاست جمهوری اکبر هاشمی رفسنجانی به مدت هشت سال رئیس ستاد مشترک سپاه و سپس جانشین فرمانده سپاه بود.