غلامحسین محسنی اژه‌ای، سخنگوی قوه قضائيه، برکناری غلامحسين اسماعيلی، رئیس سازمان زندان‌ها و انتصاب وی به‌عنوان سمت رياست دادگستری استان تهران را «ارتقاء مقام» خواند.
به‌گزارش خبرگزاری دانشجويان ايران، ايسنا، محسنی اژه‌ای ضمن اعلام این نظر درباره این‌که رفتن غلامحسين اسماعيلی از سازمان زندان‌ها ارتباطی با رویدادهای اخير در بازداشتگاه اوين دارد، گفت: «اين موضوع هيچ ارتباطی با اتفاقی که در بند ۳۵۰ بازداشتگاه اوين رخ داد، ندارد.»
سخنگوی قوه قضائیه گفته است که اين تصميم از حدود ۴۰ تا۵۰ روز قبل گرفته شده بود.
در پی رویدادهای چند روز اخیر در زندان اوین و حمله مأموران امنیتی به زندانیان سیاسی بند ۳۵۰، آیت‌الله صادق لاریجانی، رئیس قوه قضائیه، صبح روز چهارشنبه سوم اردیبهشت‌ماه غلامحسین اسماعیلی، رئیس سازمان زندان‌ها را از سمت خود برکنار کرد.
در روز پنج‌شنبه ۲۸ فروردین‌ماه، سایت کلمه گزارش داد در یورشی که مأموران وزارت اطلاعات ایران، اطلاعات سپاه پاسداران و بیش از ۱۰۰ نفر از سربازان گارد سازمان زندان‌ها به بند ۳۵۰ اوین انجام دادند، بیش از ۳۰ زندانی سیاسی مورد ضرب و شتم قرار گرفته و گروهی از آن‌ها به سلول‌های انفرادی منتقل شدند.
حمله مأموران پس از آن صورت گرفت که زندانیان نسبت به آن‌چه «برنامه خشن بازرسی» گزارش شده اعتراض کردند.
پس از انتشار این خبر بود که غلامحسین اسماعیلی به‌عنوان رئیس سازمان زندان‌ها بارها در رسانه‌ها ظاهر شد و از عملکرد نیروهای امنیتی دفاع کرد. وی یورش به زندانیان سیاسی را یک بازرسی عادی دانسته و تأکید کرده که هیچ درگیری و ضرب و شتمی رخ نداده است.