کلیسای سن استپانوس یا کلیسای استفانوس مقدس، در میراث جهانی یونسکو ثبت شده و دومین کلیسای مهم ارامنه ایران است. سن استپانوس یا سن استفان اولین شهید جنبش مسیحیت است که در ۲۶ دسامبر سال ۳۶ میلادی در بیت‌المقدس توسط یهودیان مخالف عیسی مسیح سنگسار شد.
این بنا در استان آذربایجان شرقی در ۱۷ کیلومتری غرب شهر جلفا و در فاصله ۳ کیلومتری کرانه جنوبی رودخانه ارس در محلی به نام قزل وانک (صومعه سرخ) واقع شده است. قدمت این کلیسا به سده نهم میلادی می‌رسد اما پس از آنکه به علت زلزله دچار آسیب‌های جدی می‌شود، در دوران صفویه مورد مرمت و بازسازی قرار می‌گیرد.
در زیر گنبد اصلی نقاشی‌هایی به شیوهٔ نقاشی‌های قرون ۱۶ و ۱۷ میلادی که در منتهی‌الیه فضای داخلی محراب قرار دارد به چشم می‌خورد. در دیوارهای خارجی کلیسا، نقش برجسته‌های زیبایی، همچون سنگسار شدن استپانوس مقدس در ضلع شرقی، مصلوب شدن مسیح در ضلع غربی و عروج مسیح وجود دارد.
