با گذشت يک هفته از مطرح شدن سوال از محمود احمدی‌نژاد، رئيس‌جمهور ايران، نمايندگان مجلس بر سر عملی‌شدن آن با هم اختلاف پيدا کرده‌اند.
روح‌الله حسينيان يکی از نمايندگان اصولگرای مجلس به خبرگزاری فارس گفته آيت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی از طرح سؤال از رئيس‌جمهور «راضی نيست.»
علی مطهری که از طراحان اصلی سوال از احمدی‌نژاد است، پنجم تير ۱۳۹۰ اين طرح را با ۱۰۰ امضا به هيأت رئيسه مجلس تحويل داد.
به گفته اين نماينده مجلس، هدف از طرح سوال از احمدی‌نژاد «روشن شدن ابهامات و زدودن گرد و غبارها» است.
روح‌الله حسينيان يکی از نمايندگان اصولگرای مجلس گفته آيت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی از طرح سؤال از رئيس‌جمهور راضی نيست
به گفته حسينيان شماری از نمايندگانی که طرح سوال از احمدی‌نژاد را امضا کرده‌اند، به دليل اينکه اين طرح را به «مصلحت» کشور نمی‌دانند، امضای خود را پس خواهند گرفت.
اما مصطفی کواکبيان يکی از نمايندگان اصلاح‌طلب به تارنمای تابنک گفته «هيچ مانعی» برای سوال از رئيس‌جمهور وجود ندارد.
در همين حال هيأت رئيسه مجلس شورای اسلامی ايران اعلام کرده طرح سئوال از محمود احمدی‌نژاد، رئيس جمهور را به «مصلحت» کشور نمی‌داند.
محمد دهقان، عضو هيأت رئيسه مجلس به خبرگزاری مهر گفته است هيأت رئيسه تصميم گرفته است با علی مطهری از موافقان سئوال از احمدی‌نژاد گفت‌وگو کند تا طرح سئوال از رئيس‌جمهور در دستور کار مجلس قرار نگيرد.
روزنامه کيهان چاپ تهران نيز در شماره سه‌شنبه هفت تير در واکنش به طرح سوال از رئيس‌جمهور نوشته است: «در شرايطی که رهبر معظم انقلاب بارها به وحدت و همکاری ميان قوای قانون‌گذار و اجرايی کشور تأکيد داشته و حتی در ديدار اخير با نمايندگان نيز، مجلس را به وضع قوانينی در راستای تسهيل در کار دولت توصيه نمودند، چنين طرحی برای سئوال از رئيس جمهور، آن هم برای ايجاد وحدت، امری غيرقابل توجيه به نظر می رسد.»
مواضع روزنامه کيهان از آن جهت اهميت دارد که مدير آن توسط آيت‌الله علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی منصوب می‌شود.
طرح سئوال از رئيس‌جمهور نخستين بار است که در تاريخ جمهوری اسلامی، از سوی نمايندگان مجلس مطرح شده است.
با اين حال پيش از اين نيز، شماری از نمايندگان مجلس نسبت به پيامدهای اين طرح هشدار داده بودند.
رضا اکرمی يکی از نمايندگان مجلس ايران، ارديبهشت ٨٩ گفته بود در حال حاضر که علی مطهری يکی از نمايندگان مجلس درباره سئوال از رئيس‌جمهور حرف می‌زند، می‌خواهند «پوستش را بکنند چه برسد به اينکه بخواهيم اين کار را اجرا کنيم.»
تحليلگران مسائيل ايران می‌گويند طرح سوال از رئيس‌جمهور تا هنگامی که آيت‌الله خامنه‌ای با آن «مخالف» باشد به جريان نخواهد افتاد.